Jerome Karle, ursprungligt namn Jerome Karfunkle, (född 18 juni 1918, Brooklyn, New York, USA - dog 6 juni 2013, Annandale, Virginia), amerikansk kristallograf som tillsammans med Herbert A. Hauptman tilldelades Nobelpriset för Kemi 1985 för deras utveckling av matematiska metoder för att härleda molekylstrukturen hos kemiska föreningar från mönstren som bildas när röntgenstrålar diffraheras av deras kristaller.
Karle var en klasskamrat av Hauptmans vid City College i New York, där de båda tog examen 1937. Karle fortsatte med en doktorsexamen. examen i fysisk kemi vid University of Michigan 1943. Efter att ha arbetat på Manhattan-projektet 1943–46, gick han med i Naval Research Laboratory (NRL) 1946 och blev 1967 huvudforskare för forskning om materiens struktur; han gick i pension 2009.
Efter andra världskriget började Karle och Hauptman samarbeta vid NRL för att studera kristallstrukturer. De två männen utformade matematiska ekvationer för att beskriva arrangemangen för många fläckar som visas på fotografisk film som ett resultat av kristallens diffraktion av röntgenstrålar. Deras ekvationer möjliggjorde lokalisering av atomer i kristallens molekyler på grundval av en analys av fläckarnas intensitet. Efter att deras metod publicerades 1949 fick den försummelse under några år tills Karles kemfru, Isabella, påpekade sina potentiella tillämpningar. Gradvis började kristallografer använda metoden för att bestämma den tredimensionella strukturen hos tusentals små biologiska molekyler, inklusive de för många hormoner, vitaminer och antibiotika. Innan Karle och Hauptman utvecklade sin metod, tog det två år att härleda strukturen för en enkel biologisk molekyl; under 1980-talet, med kraftfulla datorer för att utföra de komplexa beräkningar som deras metod krävde, tog uppgiften ungefär två dagar.
