Kapslar och slemmlager
Många bakterieceller utsöndrar en del extracellulärt material i form av en kapsel eller ett slamlager. Ett slemmlager är löst associerat med bakterien och kan lätt tvättas bort, medan en kapsel är fast bunden till bakterien och har bestämda gränser. Kapslar kan ses under ett ljusmikroskop genom att placera cellerna i en suspension av Indien-bläck. Kapslarna utesluter bläcket och visas som tydliga glorier som omger bakteriecellerna. Kapslar är vanligtvis polymerer av enkla sockerarter (polysackarider), även om kapseln av Bacillus anthracis är tillverkad av polyglutaminsyra. De flesta kapslar är hydrofila ("vattenälskande") och kan hjälpa bakterien att undvika uttorkning (uttorkning) genom att förhindra vattenförlust. Kapslar kan skydda en bakteriecell från intag och förstörelse av vita blodkroppar (fagocytos). Medan den exakta mekanismen för att undkomma fagocytos är oklar, kan det uppstå eftersom kapslar gör bakterieytkomponenter mer hala, vilket hjälper bakterien att undkomma uppslukning av fagocytiska celler. Närvaron av en kapsel i Streptococcus pneumoniae är den viktigaste faktorn i dess förmåga att orsaka lunginflammation. Mutanta stammar av S. pneumoniae som har tappat förmågan att bilda en kapsel tas lätt upp av vita blodkroppar och orsakar inte sjukdom. Föreningen mellan virulens och kapselbildning finns också i många andra bakterier.
Ett kapselskikt av extracellulärt polysackaridmaterial kan omsluta många bakterier i en biofilm och tjänar många funktioner. Streptococcus mutans, som orsakar tandkärl, delar sackarosen i mat och använder ett av sockret för att bygga sin kapsel, som fastnar fast vid tanden. Bakterierna som fångas i kapseln använder det andra sockret för att driva sin ämnesomsättning och ger en stark syra (mjölksyra) som attackerar tandemaljen. När Pseudomonas aeruginosa koloniserar lungorna hos personer med cystisk fibros producerar den en tjock kapselpolymer av alginsyra som bidrar till svårigheten att utrota bakterien. Bakterier av släktet Zoogloea utsöndrar fibrer av cellulosa som binder in bakterierna i en flock som flyter på vätskans yta och håller bakterierna utsatta för luft, ett krav på metabolism av denna släkt. Några stavformade bakterier, såsom Sphaerotilus, utsöndrar långa kemiskt komplexa rörformiga mantlar som omsluter ett betydande antal bakterier. Mantlarna på dessa och många andra miljöbakterier kan bli täckta med järn- eller manganoxider.
Flagella, fimbria och pili
Många bakterier är rörliga, kan simma genom ett flytande medium eller glida eller svärma över en fast yta. Simning och värmande bakterier har flagella, som är de extracellulära bilagorna som behövs för rörlighet. Flagella är långa, spiralformade trådar gjorda av en enda typ av protein och ligger antingen i ändarna på stavformade celler, som i Vibrio cholerae eller Pseudomonas aeruginosa, eller över hela cellytan, som i Escherichia coli. Flagella finns på både gram-positiva och gram-negativa stavar men är sällsynta på cocci och fångas i det axiella filamentet i spirochetes. Flagellumet är fäst vid sin bas till en baskropp i cellmembranet. Den protomotiva kraften som alstras vid membranet används för att vända det flagellära filamentet på sättet som en turbin drivs av flödet av vätejoner genom baskroppen in i cellen. När flagellerna roterar moturs, simmar bakteriecellen i en rak linje; medurs rotation resulterar i simning i motsatt riktning eller, om det finns mer än en flagellum per cell, i slumpmässig tumling. Chemotaxis tillåter en bakterie att anpassa sitt badbeteende så att den kan känna och migrera mot ökande nivåer av en attraherande kemikalie eller bort från en avvisande.
Bakterier kan inte bara simma eller glida mot gynnsammare miljöer, utan de har även hängor som låter dem hålla fast vid ytor och hålla sig från att tvättas bort med flytande vätskor. Vissa bakterier, såsom E. coli och Neisseria gonorrhoeae, producerar raka, styva, spikelike utsprång som kallas fimbriae (latin för "trådar" eller "fibrer") eller pili (latin för "hårstrån"), som sträcker sig från bakteriens yta och fästas vid specifika sockerarter på andra celler - för dessa stammar, resp. tarm- eller urinvägar, epitelceller. Fimbriae finns endast i gramnegativa bakterier. Vissa pili (kallad sex pili) används för att tillåta en bakterie att känna igen och hålla fast vid en annan i en process med sexuell parning som kallas konjugation (se nedan Bakteriell reproduktion). Många vattenlevande bakterier producerar en sur mukopolysackarid som håller fast, vilket gör att de kan hålla fast vid stenar eller andra ytor.
