Baruj Benacerraf, (född 29 oktober 1920, Caracas, Venezuela - död 2 augusti 2011, Boston, Massachusetts, USA), venezuelansk-född amerikansk patolog och immunolog som delade (med George Snell och Jean Dausset) 1980 Nobelpriset för fysiologi eller medicin för hans upptäckt av gener som reglerar immunsvar och den roll som vissa av dessa gener spelar vid autoimmuna sjukdomar.
Från fem års ålder fram till andra världskrigets utbrott bodde Benacerraf i Paris. 1940 gick han in i Columbia University i New York, där han tog examen 1942. Han blev en naturaliserad amerikansk medborgare 1943, medan han studerade vid Medical College of Virginia i Richmond. Efter att ha fått en läkare 1945 och avbrutit på Queens General Hospital i New York City tjänade han (1946–47) i US Army Medical Corps. Benacerraf tillbringade sedan ett år i immunologisk forskning vid Columbia University College of Physicians and Surgeons. Han fortsatte till det franska nationella centret för vetenskaplig forskning vid Broussais-sjukhuset i Paris, där han fortsatte att studera immunologi. 1956 gick han med i fakulteten vid New York University (NYU) School of Medicine. Han fortsatte till professor i patologi 1960, en tjänst som han innehade fram till 1968.
Vid NYU började Benacerraf studera immunförsvarets genetik. Hans experiment ledde till att han utvecklade begreppet immunsvar (Ir) -gener, som styr immunsystemets förmåga att reagera på antigener (infektionsmedel eller främmande material som kommer in i kroppen). Mer än 30 Ir-gener hittades därefter, och det genetiska materialet fastställdes vara en del av det huvudsakliga histokompatibilitetskomplexet, ett komplicerat område av DNA involverat i immunsvar. Benacerrafs resultat hjälpte också att belysa mekanismerna bakom autoimmuna sjukdomar, såsom multipel skleros och reumatoid artrit, där immunsystemet felaktigt monterar en attack mot sina egna vävnader.
1968 blev Benacerraf chef för immunologilaboratoriet vid National Institute of Allergy and Infectious Diseases i Bethesda, Maryland. Från 1970 till 1991 var han både professor i jämförande patologi och ordförande för patologiavdelningen vid Harvard University Medical School. Han var också president (1980–91) för Sidney Farber Cancer Institute (nu Dana-Farber Cancer Institute) i Boston. Benacerraf valdes till National Academy of Sciences (1973) och fick National Medal of Science (1990). Han publicerade ett antal böcker, inklusive Textbook of Immunology (1984) och sin självbiografi, Från Caracas till Stockholm (1998).
