Som en del av USA: s administrerade Trust Territory of the Pacific Islands (TTPI) var Palau under FN: s, USA: s och Trust Territory's flaggor. Lokal önskan om en separat stat och regering uppnåddes den 1 januari 1981, och en palauansk flagga hissades vid det tillfället. En tävling hade hållits 1979 som resulterade i mer än tusen förslag; den valda skapades av Blau Skebong och godkändes av den nya regeringen den 22 oktober 1980. Denna flagga används fortfarande idag.
Den gyllene skivan representerar månen, som har speciell betydelse för den palauanska kulturen. Fullmånen anses traditionellt vara den bästa tiden för fiske, plantering och andra aktiviteter. Det sägs ge lokalbefolkningen "en känsla av värme, lugn, fred, kärlek och inhemsk enhet." Flaggens bakgrund är inte, som man kan förvänta sig, en symbol för Stilla havet; snarare hänvisar det till "den sista passagen av den utländska förvaltningsmyndigheten från vårt land." Palau uppnådde fullständigt oberoende förrän i oktober 1994, men ingen ändring gjordes i flaggan vid den tiden. Den ursprungliga flaggan från 1981 bevaras i Palau-museet i huvudstaden Koror. Palauans flagga liknar designen som flaggan i Bangladesh, men de två har olika färger och symboler.
