John Rae, (född 30 september 1813, nära Stromness, Orknneyöarna, Skottland - död den 22 juli 1893, London), läkare och utforskare i det kanadensiska arktis.
Rae studerade medicin vid University of Edinburgh (1829–33). Han utsågs (1833) kirurg till Hudson's Bay Company-fartyget som årligen besökte Moose Factory, en handelspost på James Bay (nu i Ontario). Två år senare blev han bosatt som kirurg för tjänsten och han stannade kvar där i tio år.
År 1846–47 startade Rae den första av fyra expeditioner till det kanadensiska arktis; han undersökte kommitté- och repulsbågar och bevisade att Boothia var en halvö. Han återvände till London och han utnämndes till andra befäl i Sir John Richardson på deras landsökning (1848–49) mellan floderna Mackenzie och Coppermine för Sir John Franklins förlorade arktiska expedition.
1849 placerade Hudson's Bay Company Rae som ansvarar för Mackenzie River-distriktet. Under åtta månader av 1851 ledde han ett annat parti på jakt efter Franklin, resande cirka 8 500 mil och kartlade 700 mil från Victoria Islands sydkust. Rae återvände till London men 1853–54 åkte återigen till det kanadensiska arktis, undersökte Boothia-halvön och bevisade att kung William Land var en ö. Det var på denna resa som Rae fick från Eskimos i Pelly Bay den första nyheten att medlemmarna i Franklin-expeditionen hade gått om exponering och svält.
Rae gick av från Hudson's Bay Company 1856 och bodde därefter främst i London. 1860 och 1864 deltog han i landundersökningar för att upprätta en telegraf mellan England och Amerika. Rae var känd för sin förmåga att leva utanför landet och för sin anmärkningsvärda fysiska styrka; under sina arktiska resor gick han mer än 23 000 mil. Han valdes till en kollega i det kungliga samhället 1880. I hans skrifter ingår berättelse om en expedition till kusten av arktiska havet 1846 och 1847 (1850).
