Sir John Murray, (född 3 mars 1841, Cobourg, Ont., Can.-dog 16 mars 1914, nära Kirkliston, West Lothian [nu i Edinburgh], Scot.), Skotsk kanadensisk naturforskare och en av grundarna av oceanografi, vars särskilda intressen var havsbottnar, djuphavsavlagringar och korallrevsbildning.
År 1868 började Murray samla marina organismer och göra en mängd olika oceanografiska observationer under en expedition till de arktiska öarna Jan Mayen och Spitsbergen, utanför Norge. Murray gjorde mycket för att organisera Challenger Expeditionen (1872–76), som gav extremt värdefulla bidrag i kartläggning, kartläggning och biologisk undersökning, och han hjälpte till att utrusta den med utrustning för att genomföra oceanografiska studier. Som naturforskare med expeditionen fick han ansvaret för de biologiska proverna som samlats in. Hålls i Edinburgh, lockade de uppmärksamheten från marinbiologer från hela världen i 20 år.
Efter expeditionsledarnas död, Sir Wyville Thomsons död (1882), avslutade Murray publiceringen av 50-volymrapporten om de vetenskapliga resultaten av Voyage of HMS Challenger (1880–95). Han ledde också biologiska undersökningar av skotska vatten (1882–94), undersökte djupet i skotska sjöar (1906) och deltog i en nordatlantisk oceanografisk expedition (1910). Han blev riddare 1898. Hans skrifter inkluderar uppsatsen ”På struktur och ursprung för korallrev och öar” (1880) och, med Johan Hjort, The Deepths of the Ocean (1912).
