John Rogers, (född 1627, Messing, Essex, Eng. - dog 1665 eller därefter), femte monarkistledaren i Cromwellian England.
Den andra sonen till en anglikansk prästmästare, Rogers studerade vid King's College, Cambridge. Från 1643 till 1647 undervisade han och predikade i Huntingdonshire och utsågs sedan efter hans presbyterianska ordination till rektor för Purleigh, Essex. Han blev alltmer missnöjd med den presbyterianska teologin och disciplinen och avstod från hans ordination 1648. Som föreläsare vid St. Thomas Apostles kyrka, London, uttalade han självständighet och talade för det långa parlamentet. På parlamentets begäran tjänade han vid Christ Church Cathedral, Dublin (1651–52).
När han återvände till England anslöt sig Rogers till de extrema puritanerna, kända som de femte monarkisterna, och var 1653 en av ledarna för denna tusenåriga sekt som sökte regeringen av kyrkan enligt biblisk profetia. Efter att Oliver Cromwell upprättade protektoratet, fördömde Rogers honom som avfall och krävde religionsfrihet och följaktligen fängslades i Lambeth Palace i juli 1654. Eftersom han från sin cell fortsatte att ge ledarskap för rörelsen överfördes Rogers till Windsor Castle i mars 1655 och sedan till Carisbrooke Castle på Isle of Wight, där han var innesluten till januari 1657. För att försöka upprätta en ekumenisk allians av puriter och sekterärer för att bedriva en omfattande reform, fängslades han en del av 1658.
Efter Cromwells död krävde Rogers en republikansk regering. 1659 sändes han till Irland som predikant, utnämndes till en militärkapellan och senare samma år fängslades han ännu en gång av arméledarna innan han befriades av parlamentet. Han var trött på det politiska kaoset i England och gick i landflykt i Nederländerna, där han studerade medicin och tog examen som doktor vid Utrecht (1662). Han återvände till England i december 1662 för att utöva medicin.
