Theodor Heinrich Boveri, (född 12 oktober 1862, Bamberg, Bayern [Tyskland] - död den 15 oktober 1915, Würzburg), tysk cytolog vars arbete med rundmaskägg bevisade att kromosomer är separata, kontinuerliga enheter i en cellkärna.
Boveri fick en doktorsexamen (1885) från universitetet i München och från 1885 till 1893 bedrev cytologisk forskning vid Zoological Institute i München. 1885 började han en serie studier om kromosomer. Hans första stora rapport (1887) beskrev utvecklingen av ett oförgiftat ägg, inklusive bildandet av polära kroppar (små celler som är resultatet av uppdelningen av ett obefruktat ägg). Senare beskrev han fingerformade flikar som dök upp i kärnorna i ägg från rundormen Ascaris under tidiga klyvningsstadier. Dessa strukturer, beslutade han, var kromosomer, som tidigare tros vara en del av kärnan och endast närvarande under kärnkraftsdelning. Boveris tredje rapport bevisade teorin - introducerad av den belgiska cytologen Edouard van Beneden - att ägg- och spermcellen bidrar med lika många kromosomer till den nya cellen som skapades under befruktningen.
Senare introducerade Boveri termen centrosom och demonstrerade att denna struktur är delningscentret för en delande äggcell. Han bevisade också att en enda kromosom är ansvarig för särskilda ärftliga egenskaper och visade vikten av cytoplasma genom att visa att kromosomer påverkas av cytoplasma som omger kärnan. 1893 utnämndes han till professor vid universitetet i Würzburg.
