Gananoque, stad, sydöstra Ontario, Kanada. Det ligger längs St. Lawrence River vid mynningen av Gananoque River. Staden grundades av Charles McDonald, som byggde ett kvarn där 1812 och senare planerade stadsplatsen. Dess namn sägs betyda "stenar som stiger upp ur vattnet." Staden ligger 29 km nordost om Kingston och nära Thousand Islands National Park. Gananoque har blivit en populär utväg och port till tusentals öar. Det är också en tillverkningsstad med metallverk (koppar och stål), mejerier och en bilindustri. Pop. (2006) 5 285; (2011) 5194.
